Terminologi Dan Penyebab Penyakit Infeksi

Kontak antara manusia dan mikroorganisme biasanya bersifat insidental dan dalam situasi tertentu. Kontak ini dapat bersifat menguntungkan bagi kedua organisme, Namun dalam keadaan tertentu, invasi mikroorganisme kedalam tubuh manusia dapat menimbulkan  konsekuensi yang berbahaya dan berpotensi mematikan. Konsekuensi dari invasi mikroorganisme ini secara kolektif disebut penyakit menular.

Terminologi

Inang adalah istilah yang digunakan untuk mendeskripsikan setiap organisme yang mampu mendukung kebutuhan nutrisi dan pertumbuhan fisik organisme lain. Dan manusia biasanya merupakan merupakan inang yang mendukung pertumbuhan mikroorganisme. 

Infeksi merupakan istilah yang sering digunakan untuk menggambarkan keberadaan dan kolonisasi mikroorganisme di dalam inang dan menimbulkan kerusakan pada inang tersebut. 

Namun, tidak semua interaksi antara mikroorganisme dan manusia merugikan. Beberapa area seperti permukaan dalam dan luar tubuh manusia yang terbuka biasanya dan tidak berbahaya jika dihuni oleh mikroorganisme. Kondisi ini secara kolektif disebut sebagai mikroflora normal. 

Meskipun bakteri yang berada di area tersebut memperoleh kebutuhan nutrisi dan tempat berlindung, namun inang tidak dirugikan oleh hubungan tersebut. Interaksi seperti ini disebut komensalisme, dan mikroorganisme yang berkolonisasi kadang-kadang disebut sebagai flora komensal. 

Istilah mutualisme digunakan pada interaksi di mana mikroorganisme dan inang sama-sama memperoleh manfaat dari interaksi tersebut. Sebagai contoh, mikroorganisme pada saluran usus manusia mengekstrak nutrien dari usus dan mensekresi produk sampingan berupa vitamin K yang diserap dan digunakan oleh manusia. 

Hubungan parasitik adalah hubungan di mana hanya organisme yang menginfeksi yang mendapat manfaat dari hubungan tersebut dan tuan rumah tidak mendapatkan apa-apa dari hubungan tersebut atau mengalami cedera akibat interaksi tersebut. Jika inang mengalami cedera atau kerusakan patologis sebagai respons terhadap infeksi parasit, prosesnya disebut penyakit Infeksi atau menular.

Tingkat keparahan penyakit menular dapat berkisar dari ringan hingga mengancam jiwa, tergantung pada berbagai variabel seperti kesehatan inang pada saat infeksi dan virulensi  dari mikroorganisme. 

Jenis mikroorganisme tertentu yang menimbulkan penyakit disebut mikroorganisme patogen. Pada kondisi tertentu, mikroorganisme saprofit dan flora normal dapat menjadi patogen oportunistik yang mampu menyebabkan penyakit, seperti ketika kesehatan dan kekebalan tubuh manusia dalam kondisi yang sangat lemah karena penyakit, malnutrisi, atau terapi medis.

Agen Penyebab Penyakit menular

Berbagai agen penyebab penyakit menular pada manusia merupakan mikroorganisme yang biasanya tidak terlihat oleh mata manusia. Mikroorganisme dapat berupa eukariot seperti jamur dan parasit, atau prokariot seperti bakteri. 

Eukariota dan prokariota adalah organisme karena mengandung semua enzim dan peralatan biologis yang diperlukan untuk replikasi dan memanfaatkan energi metabolisme.

Virus merupakan patogen terkecil dan tidak memiliki struktur seluler yang terorganisir, tetapi terdiri dari selubung protein yang mengelilingi inti asam nukleat DNA atau RNA. Tidak seperti eukariota dan prokariota, virus tidak mampu bereplikasi di luar sel hidup. 

Golongan Parasit seperti protozoa, cacing, dan arthropoda adalah hewan yang menginfeksi atau mengkolonisasi hewan lain yang kemudian menularkannya ke manusia atau dalam beberapa kasus langsung menginfeksi manusia.

Prion

Prion merupakan partikel protein yang tidak memiliki genom. Sejumlah penyakit terkait prion telah diidentifikasi, seperti penyakit Creutzfeldt-Jakob dan kuru pada manusia, scrapie pada domba, penyakit wasting kronis pada rusa, dan bovine spongiform encephalopathy (BSE) atau penyakit sapi gila pada sapi. 

Berbagai penyakit terkait prion menghasilkan proses dan gejala patologis yang sangat mirip pada inang dan secara kolektif disebut penyakit neurodegeneratif menular. Semuanya dicirikan oleh degenerasi neuronal non-inflamasi yang progresif lambat, menyebabkan hilangnya koordinasi (ataksia), demensia, dan kematian dalam rentang waktu berbulan-bulan hingga bertahun-tahun. 

Faktanya, penelitian terbaru menunjukkan bahwa protein prion (disebut PrP SC) sebenarnya adalah bentuk yang diubah atau dimutasi dari protein inang normal yang disebut PrP C. Perbedaan dalam struktur pasca-translasi menyebabkan kedua protein berperilaku berbeda.

PrP SC tahan terhadap aksi protease (enzim yang mendegradasi protein berlebih atau cacat) dan agregat dalam sitoplasma neuron yang terkena dampak sebagai fibril amiloid. PrP C normal sensitif terhadap protease dan muncul di permukaan sel.

Penyakit prion merupakan masalah yang signifikan bagi komunitas medis karena metode replikasinya tidak dipahami dengan jelas. Penelitian yang menyelidiki penularan penyakit prion pada hewan dengan jelas menunjukkan bahwa prion bereplikasi. 

Hal ini menimbulkan tanda tanya besar bagaimana protein dapat bereproduksi tanpa adanya materi genetik. Berdasarkan model saat ini, diyakini bahwa PrPSC berikatan dengan PrPC normal pada permukaan sel, menyebabkannya diproses menjadi PrPSC yang dilepaskan dari sel dan kemudian menyatu menjadi plak mirip amiloid di otak.

Sel kemudian mengisi ulang PrPC dan siklus berlanjut. Saat PrPSC terakumulasi, ia menyebar di dalam akson sel saraf menyebabkan kerusakan neuron inang yang semakin besar dan akhirnya melumpuhkan inang. 

Selain itu, karena prion tidak memiliki fungsi reproduksi dan metabolisme, obat antimikroba yang tersedia saat ini tidak bisa digunakan sebagai pengobatan untuk melawan dan menghentikannya.

Virus

Virus adalah patogen intraseluler obligat terkecil. Mereka tidak memiliki struktur seluler yang terorganisasi melainkan terdiri dari selubung protein atau kapsid yang mengelilingi inti asam nukleat genom dari RNA atau DNA. 

Beberapa virus tertutup dalam selubung lipoprotein yang berasal dari membran sitoplasma sel inang yang diparasit. Virus beramplop seperti anggota kelompok herpes virus, influenza dan poxvirus. 

Virus manusia dan hewan dikategorikan menurut berbagai karakteristik, seperti jenis genom virus (DNA atau RNA beruntai tunggal atau ganda), karakteristik fisik (ukuran, ada atau tidak adanya amplop membran), mekanisme replikasi (misalnya retrovirus), cara penularan (misalnya virus yang ditularkan melalui arthropoda), jaringan target, dan jenis penyakit yang dihasilkan (misalnya virus hepatitis A, B, C, D, dan E).

Virus tidak mampu bereplikasi di luar sel hidup. Mereka harus masuk ke sel hidup yang rentan dan menggunakan mesin biosintetik sel untuk menghasilkan keturunan virus.

Tidak setiap agen virus menyebabkan lisis dan kematian sel inang selama replikasi. Beberapa virus memasuki sel inang dan memasukkan genomnya ke dalam kromosom sel inang di mana ia tetap dalam keadaan laten dan tidak bereplikasi untuk waktu yang lama tanpa menyebabkan penyakit. 

Di bawah stimulasi yang tepat, virus mengalami replikasi aktif dan menghasilkan gejala penyakit berbulan-bulan hingga bertahun-tahun kemudian. Contoh virus laten adalah anggota kelompok herpes virus dan adenovirus.

Kembalinya replikasi virus laten dapat menimbulkan gejala penyakit primer misalnya herpes genital atau menyebabkan gejala yang sama sekali berbeda misalnya herpes zoster.

Keluarga virus yang banyak mendapat perhatian di media belakangan ini adalah Orthomyxoviridae atau virus flu. Sebagian besar perhatian baru-baru ini telah difokuskan pada varian H5N1, umumnya dikenal sebagai virus flu burung. Virus flu burung berbeda dari virus influenza manusia pada inang yang biasa mereka infeksi. 

Virus flu burung biasanya menginfeksi unggas liar, namun terkadang virus baru dapat dihasilkan dari mutasi genetik yang membuatnya bisa menginfeksi manusia. Ketika ini terjadi, populasi manusia lebih rentan karena virus tidak dikenal oleh sebagian besar sistem kekebalan tubuh.

Sejak awal 1980-an, anggota kelompok retrovirus telah mendapat banyak perhatian setelah identifikasi human immunodeficiency virus (HIV) sebagai agen penyebab Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS). Retrovirus memiliki mekanisme replikasi yang unik. Setelah masuk ke dalam sel inang, genom RNA virus pertama kali diterjemahkan menjadi DNA oleh enzim virus yang disebut reverse transcriptase.

Salinan DNA virus kemudian diintegrasikan ke dalam kromosom inang di suatu tempat di mana ia berada dalam keadaan laten, mirip dengan virus herpes. Pengaktifan kembali dan replikasi memerlukan pembalikan seluruh proses. Beberapa retrovirus melisiskan sel inang selama proses replikasi. 

Dalam kasus HIV, sel yang terinfeksi mengatur sistem pertahanan imunologi inang dan lisisnya menyebabkan penurunan permanen sistem kekebalan tubuh.

Selain menyebabkan penyakit menular, virus tertentu juga memiliki kemampuan untuk mengubah sel inang normal menjadi sel ganas (kanker) selama siklus replikasi. Kelompok virus ini disebut sebagai onkogenik dan mencakup retrovirus dan virus DNA tertentu, seperti virus herpes, adenovirus, dan virus papova. 

Human papillomavirus (HPV), anggota keluarga papovavirus menyebabkan kutil kulit kelamin, dan beberapa genotipe dikaitkan dengan kanker serviks. Pada bulan Juni 2006, US Food and Drug Administration and Health menyetujui vaksin pertama untuk mencegah kanker serviks, lesi genital pra kanker, dan kutil kelamin akibat HPV.

Bakteri

Bakteri prokariot secara otonom bisa mereplikasi  diri namun tidak memiliki nukleus yang terorganisir. Dibandingkan dengan sel eukariotik, sel bakteri berukuran kecil dan secara struktural relatif primitif. 

Bakteri mengandung DNA dan RNA namun tidak memiliki organel intraseluler yang terorganisir serta genomnya hanya terdiri dari satu kromosom DNA. Sebagian besar bakteri menyimpan potongan DNA sirkular ekstrakromosomal yang lebih kecil disebut plasmids.

Pada jenis tertentu, plasmid mengandung informasi genetik yang meningkatkan virulensi atau resistensi antibiotik organisme.

Sel prokariotik diatur ke dalam kompartemen internal yang disebut sitoplasma yang berisi mesin reproduksi dan metabolisme sel. Sitoplasma dikelilingi oleh membran lipid yang fleksibel yang disebut membran sitoplasma.

Struktur dan sintesis dinding sel menentukan bentuk mikroskopis bakteri misalnya bulat (kokus), heliks (spirila), atau memanjang (basil). Sebagian besar bakteri menghasilkan dinding sel yang terdiri dari polimer khas yang dikenal sebagai peptidoglikan.

Polimer ini diproduksi hanya oleh prokariota dan oleh karena itu merupakan target yang menarik untuk terapi antibakteri. Beberapa bakteri mensintesis kapsul ekstraseluler yang terdiri dari protein atau karbohidrat. Kapsul melindungi organisme dari bahaya lingkungan seperti sistem imunologi inang.

Bakteri tertentu bersifat motil karena memiliki organel pelengkap seperti cambuk eksternal yang disebut flagela. Flagella berputar seperti propeller, mengangkut organisme melalui lingkungan cair.

Bakteri juga dapat menghasilkan struktur seperti rambut yang menonjol dari permukaan sel yang disebut pili atau fimbriae, yang memungkinkan organ tersebut melekat pada permukaan seperti selaput lendir atau melekat pada bakteri lain.

Kebanyakan prokariota bereproduksi secara aseksual dengan membelah diri. Cara organisme membelah dapat mempengaruhi morfologi mikroskopis. Misalnya, ketika coccus membelah menjadi rantai mereka disebut streptococci, jika berpasangan disebut diplococcus, dan jika dalam kelompok disebut stafilokokus. 

Laju pertumbuhan bakteri sangat bervariasi di antara spesies yang berbeda dan sangat bergantung pada kondisi pertumbuhan fisik dan ketersediaan nutrisi. Di laboratorium, bakteri yang ditempatkan di lingkungan pertumbuhan yang sesuai, seperti lempeng agar bereproduksi hingga membentuk koloni yang terdiri dari jutaan bakteri dalam waktu tertentu.

Di alam bebas, bakteri lebih sering menempel di permukaan benda atau media tertentu, menghasilkan citra terstruktur yang disebut biofilm. Organisasi dan struktur biofilm memungkinkan akses ke nutrisi yang tersedia dan pembuangan sisa metabolisme. 

Di dalam biofilm, organisme menggunakan pensinyalan kimia sebagai bentuk komunikasi antar sel primitif untuk mewakili keadaan lingkungan. Sinyal-sinyal ini memberi sinyal ketika nutrisi yang cukup tersedia untuk perkembangbiakan atau ketika kondisi lingkungan memerlukan dormansi atau evakuasi. 

Contoh biofilm di alam dapat ditemukan di permukaan lingkungan perairan dan pada manusia, seperti pada saluran pembuangan yang tersumbat. Penampakan fisik koloni bakteri yang ditumbuhkan pada lempeng agar bisa sangat berbeda untuk spesies yang berbeda.

Beberapa bakteri menghasilkan pigmen yang memberi warna unik pada koloni. Beberapa bakteri menghasilkan spora yang sangat resisten ketika dihadapkan pada lingkungan yang tidak menguntungkan. 

Spora dapat eksis dalam keadaan dorman hampir tanpa batas sampai kondisi pertumbuhan yang sesuai ditemukan, pada saat spora berkecambah dan organisme melanjutkan metabolisme dan replikasi normal.

Bakteri adalah bentuk kehidupan yang sangat mudah beradaptasi. Mereka ditemukan tidak hanya pada manusia dan inang lainnya, tetapi di hampir setiap lingkungan ekstrem di bumi. Namun, setiap spesies bakteri memiliki seperangkat parameter pertumbuhan yang optimal seperti nutrisi, suhu, cahaya, kelembaban, dan atmosfer. 

Beberapa jenis bakteri membutuhkan oksigen untuk pertumbuhan dan metabolisme disebut aerob, sedangkan jenis bakteri yang tidak dapat bertahan hidup di lingkungan yang mengandung oksigen dan disebut bakteri anaerob. Selain itu, terdapat jenis bakteri yang mampu menyesuaikan metabolismenya dengan kondisi aerobik atau anaerobik disebut anaerobik fakultatif.

Di laboratorium, bakteri umumnya diklasifikasikan menurut kenampakan mikroskopis dan sifat pewarnaan sel. Pewarnaan Gram yang dikembangkan pada tahun 1884 oleh ahli bakteriologi Denmark Christian Gram, masih merupakan prosedur pewarnaan yang paling banyak digunakan. 

Karakteristik pewarnaan dan morfologi mikroskopis digunakan dalam kombinasi untuk mendeskripsikan bakteri. Sebagai contoh, Streptococcus pyogenes penyebab demam berdarah dan demam rematik adalah organisme streptococcus gram positif yang berbentuk bulat, tumbuh berantai, dan berwarna ungu dengan pewarnaan Gram. 

Cara lain untuk mengklasifikasikan bakteri menurut sifat pewarnaan mikroskopis adalah pewarnaan tahan asam. Karena kandungan dan komposisi asam lemak membran selnya yang unik, bakteri tertentu resisten terhadap dekolorisasi saat diberi larutan alkohol asam. Organisme ini disebut bakteri tahan asam seperti Mycobacterium tuberculosis.

Untuk tujuan taksonomi yaitu identifikasi dan klasifikasi, setiap bakteri dikategorikan ke dalam kelompok kecil biokimia dan organisme terkait genetik yang disebut genus, dan selanjutnya dibagi menjadi individu yang berbeda dalam genus yang disebut spesies. Penetapan genus dan spesies organisme tercermin dalam namanya, misalnya Staphylococcus aureus.

Spirochete

Spirochetes adalah kategori bakteri eksentrik yang disebutkan secara terpisah karena morfologi selulernya yang tidak biasa dan mekanisme motilitasnya yang khas.

Secara teknis, spirochetes adalah batang gram negatif tetapi unik karena bentuk selnya heliks dan ukuran organisme yang lebih panjang. Serangkaian filamen melilit pada dinding sel dan memanjang sepanjang sel digunakan untuk menggerakkan organisme pada lingkungan berair.

Spirochetes adalah organisme anaerobik dan terdiri dari tiga genus, yaitu Leptospira, Borrelia, dan Treponema. Setiap genus memiliki strain saprofit dan patogen. Leptospira patogen menginfeksi berbagai macam hewan. Penularan ke manusia terjadi melalui kontak dengan hewan yang terinfeksi atau lingkungan yang terkontaminasi. 

Leptospires mendapatkan akses ke host secara langsung melalui selaput lendir atau luka di kulit dan dapat menghasilkan penyakit yang parah dan berpotensi fatal yang disebut sindrom Weil. 

Sebaliknya, borrelia ditularkan dari hewan yang terinfeksi ke manusia melalui gigitan vektor arthropoda seperti kutu atau caplak. Yang termasuk dalam genus Borrelia adalah agen penyebab  penyakit demam Borrelia recurrentis dan penyakit Lyme (Borrelia burgdorferi).

Spesies Treponema patogen tidak memerlukan perantara dan menyebar dari individu ke individu lain melalui kontak langsung. Anggota genus yang paling penting adalah Treponema pallidum, agen penyebab sifilis.

Mikoplasma

Mikoplasma. Mikoplasma adalah prokariota uniseluler yang mampu bereplikasi secara independen. Organisme ini berukuran kurang dari sepertiga ukuran bakteri dan mengandung genom DNA kecil kira-kira setengah ukuran kromosom bakteri. 

Sel terdiri dari sitoplasma yang dikelilingi oleh membran peptidoglikan. Membran ini tidak kaku sehingga tampilan mikroskopis sel sangat bervariasi, mulai dari bentuk kokoid hingga filamen. Selain itu, mikoplasma resisten terhadap antibiotik penghambat dinding sel seperti penisilin dan sefalosporin.

Mycoplasma yang mempengaruhi manusia dibagi menjadi tiga genus, yaitu Mycoplasma, Ureaplasma, dan Acholeplasma. Mycoplasma dan ureaplasma  membutuhkan kolesterol dari lingkungan untuk menghasilkan membran sel sedangkan acholeplasma tidak. 

Pada inang manusia, mikoplasma bersifat komensal. Namun, sejumlah spesies mampu menimbulkan penyakit serius seperti pneumonia (Mycoplasma pneumoniae), infeksi genital (Mycoplasma hominis dan Ureaplasma urealyticum), dan infeksi pernapasan yang ditularkan secara maternal ke bayi dengan berat badan lahir rendah (U. urealyticum).

Riketsia dan Klamidia

Kelompok organisme ini memadukan karakteristik agen virus dan bakteri untuk menghasilkan penyakit pada manusia. Semuanya bersifat patogen intraseluler obligat, seperti virus, tetapi menghasilkan dinding sel peptidoglikan yang kaku, bereproduksi secara aseksual dengan pembelahan sel, dan mengandung RNA dan DNA, mirip dengan bakteri.

Rickettsia bergantung pada sel inang untuk mendapatkan vitamin dan nutrisi esensial, tetapi Chlamydiaceae tampaknya mendapatkan energi dan nutrisi dari perantara metabolisme energi seperti adenosine triphosphate (ATP). 

Rickettsia menginfeksi tetapi tidak menimbulkan penyakit pada sel arthropoda tertentu seperti pinjal, caplak, dan lice. Organisme tersebut secara tidak sengaja ditularkan ke manusia melalui gigitan arthropoda sebagai vektor dan menghasilkan sejumlah penyakit yang berpotensi mematikan seperti demam bintik Rocky Mountain dan tifus epidemik

Chlamydiaceae sedikit lebih kecil dari Rickettsia tetapi secara struktural mirip dan ditransmisikan langsung antara vertebrata yang rentan tanpa inang arthropoda perantara. Pada proses penularan, Chlamydia menempel dan memasuki sel inang lalu berubah menjadi badan retikulat yang lebih besar dan mengalami replikasi aktif kemudian dilepaskan ke lingkungan ekstraseluler untuk memulai siklus infeksi lain.

Penyakit klamidia pada manusia antara lain infeksi genital menular seksual (Chlamydophila trachomatis), infeksi mata dan pneumonia pada bayi baru lahir (Chlamydia trachomatis), infeksi saluran pernapasan atas dan bawah pada anak-anak, remaja, dan dewasa muda (Chlamydia pneumoniae), dan penyakit pernapasan yang didapat dari unggas yang terinfeksi (Chlamydia psittaci).

Organisme dalam famili Anaplasma antara lain genera Ehrlichia, Anaplasma, Neorickettsia, dan Wolbachia yang direorganisasi juga merupakan organisme intraseluler obligat yang strukturnya menyerupai Rickettsiaceae dan menghasilkan berbagai penyakit hewan dan manusia, beberapa di antaranya memiliki vektor kutu. 

Organisme ini menargetkan sel darah putih mononuklear dan polimorfonuklear inang untuk infeksi dan, mirip dengan Chlamydiaceae, berkembang biak dalam sitoplasma leukocytes yang terinfeksi di dalam vakuola yang disebut morula. 

Berbeda dengan aceae Chlamydia, bagaimanapun, Anaplasma tidak memiliki siklus hidup yang pasti dan tidak bergantung pada sel inang untuk produksi energi. Ehrlichia sennetsu, yang terutama terbatas di Jepang, menghasilkan penyakit yang disebut demam sennetsu yang menyerupai infeksi mononukleosis. 

Penyakit yang disebabkan organisme ini berbeda dengan Anaplasma lainnya karena berhubungan dengan memakan ikan mentah yang terinfeksi parasit E. sennetsu. Infeksi paling umum yang disebabkan oleh Anaplasma adalah ehrlichiosis monositik dan granulositik pada manusia. 

Ehrlichiosis monocytic pada manusia adalah penyakit yang disebabkan oleh Ehrlichia chaffeensis dan E. canis. Tingkat keparahan penyakit klinis berkisar dari ringan hingga mengancam jiwa. Manifestasi klinisnya antara lain malaise, anoreksia, mual, demam, dan sakit kepala. Penurunan sel darah putih (leukopenia) dan trombosit (trombositopenia) sering terjadi. 

Gejala sisa yang parah meliputi gagal napas berat, ensefalopati, dan gagal ginjal akut. Penyakit ini biasanya lebih parah pada orang lanjut usia dan orang dengan gangguan fungsi kekebalan tubuh (misalnya, HIV/AIDS). 

Jamur

Jamur adalah saprofit eukariotik yang hidup bebas yang ditemukan pada setiap habitat di bumi. Beberapa jenis merupakan mikroflora normal pada manusia. Hanya sedikit jamur yang mampu menyebabkan penyakit pada manusia, dan sebagian besar merupakan infeksi insidental pada kulit dan jaringan subkutan. 

Meskipun biasanya tidak berbahaya, jamur dapat menyebabkan penyakit oportunistik yang mengancam jiwa ketika daya tahan tubuh manusia sangat menurun atau dalam kondisi lemah.

Berdasarkan perbedaan morfologinya, Fungi atau jamur dapat bagi menjadi dua kelompok yaitu Yeast dan mold. Yeast adalah organisme bersel tunggal, kira-kira seukuran sel darah merah, yang bereproduksi dengan proses tunas. Tunas terpisah dari sel induk dan matang menjadi sel anak yang identik. 

Jamur menghasilkan filamen panjang, berongga, bercabang yang disebut hifa. Beberapa jamur menghasilkan dinding silang, yang memisahkan hifa menjadi kompartemen. Jamur tertentu mampu tumbuh sebagai yeast pada satu suhu dan sebagai mold pada suhu lain. Organisme ini disebut jamur dimorfik dan beberapa jenis merupakan patogen manusia seperti blastomycosis (Blastomyces dermatitidis), histoplasmosis (Histoplasma capsulatum), dan coccidioidomycosis (Coccidioides immitis).

Munculnya koloni jamur cenderung mencerminkan komposisi selulernya. Koloni yeast umumnya halus dengan tekstur seperti lilin atau krim. sedangkan mold cenderung menghasilkan koloni seperti kapas atau bubuk yang terdiri dari gulungan hifa yang secara kolektif disebut miselium. Miselium dapat menembus permukaan atau menonjol di atas koloni seperti akar dan cabang pohon.

yeast dan mold menghasilkan lapisan dinding sel kaku yang secara kimiawi tidak berhubungan dengan peptidoglikan bakteri dan karena itu tidak rentan terhadap efek antibiotik seperti penisilin. 

Sebagian besar jamur mampu bereproduksi secara seksual atau aseksual. Proses melibatkan fusi zigot dengan produksi zigospora rekombinan. Reproduksi aseksual terjadi melalui pembentukan spora yang sangat resisten yang muncul dari hifa. 

Jamur dapat menimbulkan penyakit manusia berupa infeksi pada permukaan kulit. Penyakit yang disebabkan oleh jamur seperti mikosis superfisial dan pada kondisi yang lebih serius adalah mikosis sistemik. 

Jamuri seperti Candida albicans adalah flora komensal kulit, selaput lendir, dan saluran pencernaan dan mampu tumbuh pada kisaran suhu yang lebih bervariasi. Mekanisme kekebalan tubuh biasanya membuat jamur yang berkolonisasi dan tetap terkendali. Perubahan kondisi tubuh akibat penyakit atau terapi antibiotik dapat mengganggu keseimbangan ini dan memungkinkan pertumbuhan jamur berlebihan dan menyebabkan infeksi oportunistik.

Parasit

Dalam arti sempit, organisme apa pun yang memperoleh manfaat dari hubungan biologisnya dengan organisme lain adalah parasit. Namun dalam mikrobiologi klinis, istilah parasit merujuk pada hewan yang menginfeksi dan menyebabkan penyakit pada manusia atau hewan lain seperti  protozoa, cacing, dan arthropoda.

Protozoa adalah organisme uniseluler eukariotik dengan komponen seluler lengkap, termasuk nukleus dan organel lainnya. Reproduksi bisa berlangsung secara seksual atau aseksual, dan siklus hidup dengan beberapa tahap pematangan serta membutuhkan lebih dari satu inang untuk penyelesaiannya. 

Sebagian besar protozoa bersifat saprofit, tetapi beberapa telah beradaptasi dengan lingkungan manusia dan menyebabkan berbagai penyakit, seperti malaria, disentri amoeba, dan giardiasis. 

Infeksi protozoa dapat ditularkan secara langsung dari individu ke individu lainnya seperti melalui kontak seksual, dan secara tidak langsung melalui air atau makanan yang terkontaminasi, atau melalui vektor arthropoda.

Penularan langsung atau tidak langsung terjadi akibat menelan kista atau spora yang dikeluarkan melalui feses individu yang terinfeksi. Ketika kista mencapai usus, protozoa matang menjadi bentuk vegetatif yang disebut trofozoit yang mampu bereproduksi secara aseksual atau membentuk kista. Kebanyakan trofozoit motil dengan gerakan flagela, silia, atau amuboid.

Cacing adalah kumpulan parasit yang meliputi nematoda (cacing gelang), cestoda (cacing pita) dan trematoda (cacing isap). Cacing bereproduksi secara seksual di dalam inang dan beberapa membutuhkan inang perantara untuk perkembangan dan pematangan. 

Manusia dapat menjadi inang cacing secara definitif atau perantara. Penularan penyakit cacing terjadi terutama akibat tertelan telur atau penetrasi stadium larva melalui kulit secara langsung atau dengan bantuan vektor. 

Infeksi cacing dapat mengenai banyak sistem organ dan tempat seperti usus, hati, paru-paru, saluran kemih, sistem peredaran darah, saraf pusat, dan otot.

Arthropoda parasit manusia dan hewan termasuk vektor penyakit menular, misalnya kutu, nyamuk, lalat dan ektoparasit. Ektoparasit menempati permukaan tubuh bagian luar dan menyebabkan kerusakan jaringan atau peradangan sekunder akibat gigitan atau membentuk lubang.

Ektoparasit manusia yang paling sering adalah tungau, kutu kepala, tubuh, dan kemaluan,. Penularan ektoparasit terjadi secara langsung melalui kontak dengan arthropoda atau telurnya melalui media pakaian, tempat tidur, atau perlengkapan seperti sisir dan sikat. Beberapa jenis ektoparasit adalah vektor penyakit menular lainnya seperti tifus endemik dan wabah pest .

Kesimpulan

Sepanjang hidup, manusia secara terus-menerus akan terpapar dan bisa terinfeksi oleh berbagai jenis organisme mikroskopis. Namun pada kondisi  normal tubuh dilindungi oleh sistem imunitas sebagai mekanisme pertahanan sebagai mekanisme pertahanan seperti barier mukosa dan kulit, serta sistem kekebalan lainnya.

Selain itu sebagian besar mikroorganisme di lingkungan bersifat  tidak berbahaya bagi manusia. Penyakit akan timbul jika  faktor-faktor tertentu melemahkan daya tahan tubuh inang (manusia) atau peningkatan virulensi mikroorganisme dan mengganggu keseimbangan. Sejauh mana keseimbangan bergeser akan menentukan terjadinya penyakit dan tingkat keparahannya.

Keragaman mikroorganisme yang mampu menyebabkan penyakit menular pada manusia dan kondisi imunosupresif akibat terapi atau penyakit seperti AIDS, bisa menyebabkan penyakit infeksi menular meningkat secara dramatis. 

Sumber:  Port C. M & Matfin G. 2009. Pathophysiology: Concepts of Altered Health States. Lippincott Williams & Wilkins.